Expériences professionnelles

· 2020 - 2022 : Enseignante au Cours Galien.

- Préparation d’étudiants aux concours médicaux et paramédicaux.

- Conception des cours, TD et TP et leurs supports. Gestion du programme pédagogique.

· 2017 - 2019 : Projet de création d’entreprise dans le domaine de la personnalisation d’objets.

Formations à la gestion d’entreprise et à la propriété industrielle.

· 2015 - 2016 : Préparation des concours nationaux pour l’obtention du poste de Maître de Conférences : Classée à l’oral : 2^ème/9 à Reims en 2015, 3^ème/10 et 4^ème/10 à Paris en 2016.

Préparation et rédaction du second manuscrit de mon travail de post-doctorat publié en 2017.

· 2014 - 2015 : Attachée Temporaire d’Enseignement et de Recherche (ATER).

- Chargée de projets de recherche : Caractérisation des souches d’E.coli du microbiote intestinal impliquées dans la maladie de Crohn.

Valorisation et publication des résultats.

Qualifiée Maître de conférences dans les sections CNU 64 (Biochimie et Biologie moléculaire), 65 (Biologie cellulaire) et 87 (Sciences biologiques, fondamentales et cliniques).

- Chargée d'enseignement en Microbiologie.

· 2011 - 2014 : Chargée de projets recherche (post-doctorat)

- Participation à la mise au point des techniques innovantes de FRET sur molécule unique.
Caractérisation du mécanisme d’antiterminaison de la transcription médié par la protéine LicT de B.subtilis par les techniques de FRET sur molécule unique.

Animations d'équipes et gestion de projets.

Valorisation (conférences/posters) et publication des résultats.

- Enseignante vacataire en Biophysique moléculaire.

· 2006 – 2010 : Doctorante, chargée de Recherche et d'enseignement

Caractérisation de la bactérie d’intérêt biotechnologique P. haloplanktis.

Analyses bio-informatiques de séquences protéiques au sein des Protéobactéries, dont font partie E.coli et P.haloplanktis.

Valorisation (conférences/posters) et publication de résultats.

- Chargée d'enseignement en Microbiologie, en Biologie moléculaire et en Génétique.

Diplômes

· 2010 : Doctorat de Biologie, Santé et Biotechnologies. Université Paul Sabatier, Toulouse.

Mention très honorable avec les félicitations orales du jury.

· 2005 - 2006 : Master Recherche Microbiologie. Université Paul Sabatier, Toulouse.

Stages de Master 1 et Master 2 au Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires.

Mention Assez Bien en Master 1, mention Bien en Master 2 (Major de promotion : 1/14).

· 2004 : Licence de Biologie Cellulaire et de Physiologie. Faculté de Luminy, Aix-Marseille II.

Stage d’été au Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires, Marseille.

Expériences de recherche

Statut	Année	Sujet	Laboratoire	Lieu
ATER temps complet	2014 à 2015	Caractérisation des souches d’E.coli du microbiote intestinal impliquées dans la maladie de Crohn.	Microbes, Intestin, Inflammation et susceptibilité de l’Hôte.	Clermont-Ferrand
Post-doctorat	2011 à 2014	Étude du mécanisme moléculaire de l’antiterminaison de la transcription médié par la protéine LicT de B.subtilis par les techniques de FRET sur molécule unique.	Centre de Biochimie Structurale.	Montpellier
Thèse	2006 à 2010	Caractérisation du dégradosome d’ARN de la g-Protéobactérie marine adaptée au froid Pseudoalteromonas haloplanktis.	Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires.	Toulouse
Master 2 Recherche	2005 à 2006	Mise en place et amélioration des procédés de culture de la bactérie d’intérêt biotechnologique P. haloplanktis.	Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires.	Toulouse
Master 1	2004 à 2005	SopA, une protéine essentielle pour la ségrégation du plasmide F d’E.coli.	Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires.	Toulouse
Stage d’été	2004	Rôle de la protéine Bud3 dans le bourgeonnement de la levure S.cerevisiae.	Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires.	Marseille

Compétences techniques

· Techniques de laboratoire en Biologie moléculaire, en biochimie, en Biologie cellulaire, en Biophysique moléculaire et en Microbiologie.

· Outils de Bioinformatique

Outils d’analyse de séquences protéiques et nucléotidiques : BLAST, Clustal W, MEME, XSTREAM et PONDR®.

Outils d’analyse et de prédiction de structure 2D et 3D : mfold (ADN/ARN), PyMOL (ARN/AND/protéine), HNN (protéine) et HWV (protéine).

Outils classiques utilisés pour l’analyse et l’annotation de gènes bactériens (recherche de terminateur, de promoteur, …).

Outils de génomique comparative et de conservation de gènes procaryotes comme SyntTax (synténie).

Outil d’analyse et de traitement de données : Origin (ajustement de courbes : fonction gaussienne, sigmoïde, …).

· Veille, recherches bibliographiques et analyses de données

Bon esprit de synthèse et de déduction, aisance et qualité rédactionnelle.

Analyses de données/résultats et valorisation.

· Compétences en gestion de projets

Recherches, demandes de financements et réponses aux appels d’offres (de la rédaction au dépôt).

Animation d’ateliers et gestion de projets.

Rigueur et qualités d’organisation. Autonome.

Sens de la communication. Travail en équipe.

· Anglais

Très bon niveau (Directeur de thèse américain et Post-doctorat dans un laboratoire français international avec 30% d’étrangers en moyenne). Rédactions d’articles scientifiques.

Publications

· Ait-Bara, S., Clerté, C.,Declerck, N, and Margeat E. (2017) Competitive folding of RNA structures at a termination-antitermination site. RNA. May;23(5):721-734.

· Ait-Bara, S., Clerté, C., and Margeat E. (2015) Single-molecule FRET characterization of RNA remodeling induced by an antiterminator protein. Methods in Molecular Biology. Chapter 21. 1259:349-68.

· Ait-Bara, S., and Carpousis, A.J. (2015) Distribution and evolution of RNase E homologs in Bacteria and Chloroplasts. Molecular Microbiology. 97(6):1021-135.

· Ait-Bara, S., Carpousis, A.J. and Quentin Y. (2014) RNase E in the g-Proteobacteria: conservation of intrinsically disordered noncatalytic region and molecular evolution of microdomains. Molecular Genetics and Genomics. 290(3):847-62.

· Ait-Bara, S. and Carpousis, A.J. (2010) Characterization of the RNA degradosome of Pseudoalteromonas haloplanktis: conservation of the RNase E-RhlB interaction in the g-Proteobacteria. Journal of Bacteriology. 192, 5413-5423.

· Carpousis, A.J., Khemici, V., Ait-Bara, S. and Poljak, L. (2008) Co-immunopurification of multiprotein complexes containing RNA-degrading enzymes. Methods in Enzymology. 447, 65-82.

· Ait-Bara, S, 2010. Thèse de Doctorat. Caractérisation de la RNase E et du dégradosome d’ARN de la bactérie marine adaptée au froid Pseudoalteromonas haloplanktis.

Ait-Bara est mon nom de jeune fille.

Communications scientifiques

· Massier, S, Miquel, S, Dreux, N, Ait-Bara, S, Agus, A, Denizot, J, Billard, E and Barnich, N. Involvement of type VI secretion systems in virulence of adherent-invasive Escherichia coli isolated from patients with Crohn's disease. Digestive Disease Week. Mai 2015. Washington, États-Unis.

· Massier, S, Miquel, S, Dreux, N, Ait-Bara, S, Agus, A, Denizot, J, Billard, E, Darfeuille-Michaud, A and Barnich, N. Involvement of type VI secretion systems in virulence of adherent-invasive Escherichia coli isolated from patients with Crohn's disease. 10th Congress of ECCO. Février 2015. Barcelone, Espagne.

· Ait-Bara S, Clerté, C, Declerck, N and Margeat, E. Investigation of the balance between termination and antitermination mediated by an RNA remodeling protein using smFRET technique. 2013. Les nouveaux enjeux de l'ARN. SifrARN. Strasbourg. Présentation de poster.

· Ait-Bara, S, Clerté, C, Declerck, N and Margeat, E. A single molecule FRET study of binding effects of the antitermination protein LicT on RNA hairpin. 2013. 9th European Biophysics Congress. Lisbonne, Portugal. Présentation de poster.

· Ait-Bara, S, and Carpousis AJ. Caractérisation du dégradosome d’ARN de la bactérie marine adaptée au froid Pseudoalteromonas haloplanktis. 2009. Colloque AlphaT (doctorants en Biologie). Toulouse. Communication orale.

· Ait-Bara, S, and Carpousis AJ. Characterization of the RNA degradosome of the marine and cold-adapted bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis. 2009. Conférences Jacques Monod : L’ARN au centre de la régulation de l’expression des gènes, Roscoff. Présentation de poster.

· Ait-Bara, S, and Carpousis AJ. The RNA degradosome of the cold-adapted bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis. 2008. Post-Transcriptional Control of Gene Expression: Mechanisms of mRNA decay. FASEB Summer Research Conference, Italie. Présentation de poster.

* La personne soulignée a présenté les travaux.

Expériences d’enseignement

Statut

Année

Niveau

Type

Disciplines

Volume

(éq TD)

Enseignante

2020

à 2022

Bacheliers.

1^èreannée d’études médicales (PASS/LAS)

Cours & TD

- Biologie Générale.

- Biologie moléculaire.

- Prévention risques infectieux.

207h

2 x 20h

15h

ATER

Temps complet

(192h éq TD)

2014

2015

1^ère année DUT.

1^ère année de DUT.

2^ème année de DUT.

Encadrement

- Microbiologie (Microbiote & Biochimie).

- Microbiologie (Microbiote)

- Microbiologie (qualité).

- Génétique bactérienne.

- Projet tuteuré (Microbiote).

85h

24h

10h

32h

37h

10h

Vacataire

2013

à 2014

- Biophysique moléculaire.

16h

ATER

½ poste.

(98h éq TD)

2009

à 2010

TP & TD

- Génétique.

- Microbiologie générale.

- Génétique.

- Biologie Moléculaire.

16h

48h

16h

21h

Monitrice

(64h éq TD)

2006

à 2009

TD & TP

- Microbiologie.

- Microbiologie générale.

129h

60h

Compétences pédagogiques

· Conception et élaboration de cours : Cours magistraux, travaux pratiques et dirigés et leurs supports.

· Solide expérience d’enseignements à différents niveaux : Post-bac, DUT, Licence et Master.

· Capacité d’adaptation du discours selon les niveaux des étudiants.

· Fonctions d’enseignantes et diverses responsabilités :

Élaborations et surveillances d’examens, corrections de copies et de comptes rendus.

Encadrements de projets tuteurés : Recherches bibliographiques, rédaction et préparation à l’oral.

Participation aux jurys de fin d’années, jurys de stages et de projets tuteurés.

Participation aux journées portes ouvertes et au salon INFOSUP.

· Techniques pédagogiques et méthodologie d’apprentissage

Réalisation de mini-ateliers méthodologiques (courbe de l’oubli, pyramide d’apprentissage,...)

Intérêt pour la pédagogie, la vulgarisation et la valorisation.

· Outils pédagogiques et plateformes d’apprentissage/e-learning

Wooclaps, Studius/Thalamus (Cours Galien), Cap Form Express (Greta). FunMooc.

Formations

· 2018 - 2019 : Formations à l’entreprenariat :

- « Les matinées de la création ». Chambre de Commerce et d’Industrie. Clermont-Ferrand. Février 2019.

- « 5 jours pour entreprendre® ». Chambre de Commerce et d’Industrie. Clermont-Ferrand. Mars 2019.

- Salon international « C! Print ». Lyon. Février 2019.

· 2015 : Formation « Expérimentation animale niveau 1 ». Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand.

· 2012 : Formation « Purification de protéines recombinantes à l’aide du système ÄKTA ». Formation par le groupe GE Healthcare. Montpellier.

· 2012 : Techniques d’analyses en super-résolution. Centre de Biochimie Structurale. Montpellier.

· 2011 : Participation au Colloque « Les originalités de la vie ». Paris.

· 2006 - 2009 : Formations CIES (Centre d’Initiation à l’Enseignement Supérieur). Toulouse.

Déontologie de l’enseignant, Ingénierie de formation, Ingénierie pédagogique, Méthodes d’apprentissages, ...

· 2008 : Formation à la thérapie génique. Module de formation doctorale. Toulouse.

Activités d'administration & Responsabilités collectives

· 2020 - 2021 : Participation aux journées portes ouvertes du Cours Galien.

· 2016 et 2018 : Congés de maternité et gestion de mes enfants en bas âge.

· 2014 - 2015 : Participation au salon INFOSUP et aux journées portes ouvertes de l’IUT d’Aubière.

· 2012 - 2014 : Responsable des réunions Biochimie au Centre de Biochimie Structurale. Montpellier.

· 2012 - 2016 : Membre des sociétés françaises de Biophysique et de Biochimie/Biologie Moléculaire.

· En 2012 : Co-organisatrice d’une demi-journée « Poster » entre le Centre de Biochimie Structurale et les Instituts de Génétique Humaine (IGH) et de Génomique Fonctionnelle (IGF) voisins.

· En 2012 : Modératrice au colloque de l’association des doctorants de l’Université de Montpellier I & II.

· 2008 - 2009 : Trésorière de l'Association des Moniteurs de l'Enseignement Supérieur de l'Académie de Toulouse (AMESAT).

· 2008 - 2009 : Participation aux journées portes ouvertes de l’Université Paul Sabatier, Toulouse III.

· 2006 - 2009 : Membre de l’association des doctorants en Biologie de Toulouse (AlphaT) et co-organisatrice du colloque annuel.